Αλγόριθμος εντοπίζει φάρμακα για μελλοντικές πανδημίες - Νέες επιλογές για την covid-19

Μια διεθνής ομάδα ερευνητών έχει αναπτύξει έναν αλγόριθμο για την επαναστόχευση φαρμάκων, με ποιο τρόπο δηλαδή υπάρχουσες θεραπείες θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν στην αντιμετώπιση άλλων ασθενειών, από αυτές που θεραπεύουν σήμερα. Στην τελευταία της δημοσίευση, η επιστημονική ομάδα παρουσίασε αποτελέσματα για νέες επιλογές στην αντιμετώπιση της covid-19.

«Χρησιμοποιώντας αυτό το εργαλείο τεχνητής νοημοσύνης, σε συνδυασμό με δεδομένα in vitro και δεδομένα από άλλες πηγές, καταφέραμε να μοντελοποιήσουμε τη λοίμωξη SARS-CoV-2 και να αναγνωρίσουμε αρκετά φάρμακα COVID-19 που είναι διαθέσιμα αυτήν τη στιγμή ως δυνητικά αποτελεσματικά για την καταπολέμηση της επόμενης επιδημίας» δήλωσε η Ναόμι Μαρία, ανοσολόγος, επισκέπτρια επιστήμονας στο Ινστιτούτο Μαθηματικών Επιστημών Courant του Πανεπιστημίου της Νέας Υόρκης και κύρια ερευνήτρια στη μελέτη.

Η επιστημονική ομάδα ανέπτυξε το σύστημα PHENotype SIMulator (PHENSIM). Το PHENSIM προσομοιώνει τη μόλυνση των κυττάρων-ξενιστών από τον SARS-CoV-2 σε συγκεκριμένους ιστούς και στη συνέχεια εκτελεί μια σειρά πειραμάτων στον υπολογιστή -ή in silico- για τον εντοπισμό φαρμάκων που θα ήταν υποψήφια για επαναστόχευση. Ο αλγόριθμος λαμβάνει υπόψη επιλεγμένα κύτταρα, κυτταρικές σειρές και ιστούς, πολλαπλασιάζει τις επιδράσεις και τις μεταβολές των βιομορίων (διαφορετικά εκφραζόμενα γονίδια, πρωτεΐνες και microRNA) και στη συνέχεια υπολογίζει τις αντιικές επιδράσεις. Η ομάδα επιβεβαίωσε την εγκυρότητα του εργαλείου συγκρίνοντας τα αποτελέσματά του με πρόσφατα δημοσιευμένες μελέτες in vitro, υποστηρίζοντας τη δυνητική χρήση του PHENSIM στην αποτελεσματική επαναστόχευση φαρμάκων.

Οι ερευνητές είναι μέλη μιας διεπιστημονικής ομάδας που αποτελείται από ανοσολόγους, βιολόγους, χημικούς, επιστήμονες δεδομένων, θεωρητικούς παιγνίων, γενετιστές, μαθηματικούς και γιατρούς, που επιδιώκει να αναπτύξει καινοτόμες στρατηγικές για την αντιμετώπιση της Covid-19.

Διαβάστε επίσης:

Αναδυόμενες λοιμώδεις απειλές: Ανάγκη για ενίσχυση των μονάδων λοιμώξεων του ΕΣΥ